زیست‌فناوری
FoldScape ساختار پروتئین را در مراحل مختلف تاخوردگی پیش‌بینی می‌کند
این چارچوب یادگیری عمیق، به‌جای تمرکز صرف بر شکل نهایی پروتئین، مجموعه‌ای از ساختارها را در میزان مشخصی از تاخوردگی تولید می‌کند.
پژوهشگران در پیش‌چاپی در arXiv از FoldScape رونمایی کرده‌اند؛ چارچوبی مبتنی بر توالی پروتئین که ساختارهای سه‌بعدی آن را در یک میزان مشخص از تاخوردگی، با نماد Q، تولید می‌کند. هدف روش، توصیف پیوستار میان حالت‌های بازشده و شکل تاخوردهٔ پروتئین است؛ حوزه‌ای که پیش‌بینی‌کننده‌های ساختار معمولاً پوشش نمی‌دهند.
FoldScape ابتدا فاصله‌های میان باقی‌مانده‌های پروتئین را با رگرسیون‌های سلسله‌مراتبی و پنجره‌ای برآورد می‌کند، سپس زنجیره‌ها را می‌سازد و با یک رمزگشای rectified-flow از آن‌ها نمونه‌برداری می‌کند. آموزش مدل با استفاده از مسیرهای تاخوردگی درشت‌دانه و مسیرهای بازشدن مکانیکی در مقیاس اتمی انجام شده است.
ارزیابی گزارش‌شده روی ۲۰ پروتئین انسانی با طول ۳۶ تا ۸۵۷ باقی‌مانده انجام شده است. چکیده می‌گوید FoldScape در اندازهٔ نمونهٔ برابر، حدود یک مرتبهٔ بزرگی را پوشش می‌دهد؛ اما متن موجود جمله را در همین نقطه ناتمام می‌گذارد و مشخص نمی‌کند این مقایسه دقیقاً به چه معیاری اشاره دارد.
این گزارش به کمک هوش مصنوعی تهیه شده است. مطالب براساس منابع درج‌شده تنظیم شده‌اند؛ صحت مستقل همه ادعاها تضمین نمی‌شود.
منبع: arXiv · AI (پیش‌چاپ) — مشاهده منبع اصلی ↗
پیش‌چاپ پژوهشی در arXiv؛ انتشار در این مخزن به معنی داوری همتا نیست
رد این داستان در رادار
خبرهای مرتبط از آرشیو منتشرشده