پژوهشگران پیشنهاد می‌کنند مدل‌های طراحی پروتئین فقط در صورت نیاز بازچرخه‌سازی شوند

مدل‌هایی مانند AlphaFold 3، Boltz و Protenix به پیشرفت طراحی binderهای پروتئینی کمک کرده‌اند؛ هم برای تولید نامزدها و هم برای غربالگری آن‌ها. پژوهشگران در پیش‌چاپی با عنوان «Recycle only when you have to!» می‌گویند معیارهای اطمینان AlphaFold 3، از جمله ipSAE و ipTM، و نیز معیارهای سازگاری ساختاری را می‌توان مستقیماً از trunk مدل و حتی در چرخه‌های اولیهٔ بازچرخه‌سازی پیش‌بینی کرد.

به‌گفتهٔ نویسندگان، پیش‌بین پیشنهادی کم‌هزینه، مشتق‌پذیر و در هر چرخه در دسترس است. بنابراین می‌تواند به‌عنوان سیگنالی برای تصمیم‌گیری به کار رود تا بودجهٔ بازچرخه‌سازی هنگام غربالگری نامزدها هدفمندتر مصرف شود. چکیدهٔ در دسترس، روش دوم استفاده از این پیش‌بین را کامل توضیح نمی‌دهد؛ در نتیجه دربارهٔ آن نمی‌توان جزئیات بیشتری گفت.